O diagnóstico de microrganismos patogenéticos é feito por exames e técnicas diretas. A imunofluorescência, a coloração com imunoperoxidase e outros imunoensaios podem detectar antígenos microbianos específicos. As sondas genéticas identificam sequências de DNA ou RNA específicas de gênero ou espécie.
Cultura: Os meios não seletivos (não inibitórios) e os meios seletivos contêm substâncias inibidoras.
Sorodiagnóstico: Título crescente de anticorpos IgG específicos ou presença de anticorpos IgM específicos.