A metabolômica microbiana é uma das plataformas para integração de informações biológicas na microbiologia de sistemas para facilitar a compreensão das interações microbianas e das funções celulares. Ao descobrir todo o conjunto de metabólitos de um organismo e monitorar o resultado mundial das interações entre seus processos de desenvolvimento e o meio ambiente, a metabolômica pode potencialmente fornecer um instantâneo mais preciso da condição fisiológica específica da célula.
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