A investigação metabolómica está a ser utilizada para descobrir biomarcadores de diagnóstico do cancro na clínica, para compreender melhor a sua natureza complexa e heterogénea, para descobrir vias envolvidas no cancro que possam ser utilizadas para novos alvos e para monitorizar biomarcadores metabólicos durante a intervenção terapêutica. Essas abordagens metabolômicas também podem fornecer pistas para tratamentos personalizados contra o câncer, fornecendo informações úteis ao médico sobre a resposta do paciente com câncer às intervenções médicas. O objetivo final da maioria dos estudos metabolômicos do câncer é descobrir biomarcadores diagnósticos, prognósticos ou preditivos específicos do câncer para um paciente.
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