Journal of Blood & Lymph

Comparação de alterações transcriptômicas em pacientes mais jovens e mais velhos com mieloma múltiplo do estudo MMRF-CoMMpass Dados de RNA-Seq

Abstract

Merve Keskin

Contexto: Diferenças relacionadas à idade no Mieloma Múltiplo (MM) são estudadas em contexto clínico e genômico, no entanto, mudanças no transcriptoma ainda não foram determinadas. O objetivo deste estudo é identificar os genes que são expressos diferentemente em grupos de pacientes jovens e idosos e examinar a relação desses genes com vias biológicas e os medicamentos que podem ser usados.

Métodos: Os dados de RNA-Seq da coorte MMRF CoMMpass (n=634) foram usados ??para analisar genes diferencialmente expressos entre pacientes jovens e idosos. A análise de enriquecimento do conjunto de genes GO term e KEGG foi conduzida usando pacotes R. As interações fármaco-gene foram detectadas usando DGIdb.

Resultados: Globalmente, 523 genes (366 regulados positivamente, 157 regulados negativamente) foram expressos diferencialmente (p<0,05) em pacientes jovens. No total, 220 termos GO, principalmente relacionados a vias de regulação imunológica, foram enriquecidos. O conjunto de genes “interação citocina-receptor de citocina” foi enriquecido em KEGG GSEA. Entre as maiores diferenças de expressão, genes envolvidos na regulação imunológica (FCGR1A, FCER1G, TLR2), genes proto-oncogênicos conhecidos (BCL2, FGR) e genes sob investigação para associação com vários tipos de câncer (RGL4, MT-RNR1, ETS2, ENPP3, FUT7, NTNG2, PRAM1) foram identificados. Medicamentos associados às vias afetadas por esses genes foram identificados.

Conclusão: Investigações adicionais de genes expressos diferencialmente em pacientes jovens podem lançar luz sobre novas opções de tratamento.