Journal of Forensic Medicine

Desenvolvimento de marcadores moleculares em espécies medicinais de sálvia

Abstract

Yang Liu

Usamos a tecnologia Illumina Hiseq 2500 para sequenciar os genomas de cloroplasto de Salvia bowleyana , S. splendens e S. officinalis a fim de estabelecer completamente suas relações evolutivas e criar marcadores moleculares para classificação de espécies. S. bowleyana , S. splendens e S. officinalis tinham genomas de cloroplasto com 151.387, 150.604 e 151.163 pares de bases de comprimento, respectivamente. As áreas IR continham os seis genes ndhB, rpl2, rpl23, rps7, rps12 e ycf2. Há 29 repetições em tandem, 35 repetições de sequência simples, 24 repetições de sequência simples e 47, 49, 40 repetições intercaladas nos genomas de cloroplasto de S. bowleyana , S. splendens e S. officinalis , respectivamente. As 23 espécies de Salvia puderam ser distinguidas pelas três sequências intergênicas distintas (IGS) de rps16-trnQ-UUG, trnL-UAA-trnF-GAA e trnM-CAU-atpE. A análise da distância genética permitiu a identificação de 91 sequências espaçadoras intergênicas no total. As duas áreas IGS específicas (ycf3-trnS-GGA e trnG-GCC-trnM-CAU) exibem os maiores valores de K2p entre as três espécies de Salvia sob investigação. A árvore filogenética também demonstrou que as 23 espécies de Salvia formaram um grupo monofilético. A descoberta de dois conjuntos de primers de código de barras de DNA específicos do gênero. As descobertas darão uma base sólida para entender como as três espécies de Salvia são classificadas filogeneticamente. Além disso, as regiões intergênicas exclusivas podem oferecer o potencial de distinguir espécies de Salvia com base tanto no fenótipo quanto na diferenciação de segmentos gênicos.